Wissenschaftlerin ​/ Wissenschaftler für den Bereich Bioinformatik (w​/m​/d

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Angebotsart:
Arbeit

Wissenschaftlerin / Wissenschaftler für den Bereich Bioinformatik (w/m/d)

Arbeitgeber:
Max Rubner-Institut Karlsruhe, VW

Veröffentlichungsdatum:
Vor 4 Tagen veröffentlicht

Das Max Rubner-Institut ist die Forschungs- und Beratungseinrichtung des Bundes im Bereich Ernährung und Lebensmittel. An vier Standorten in Deutschland arbeiten etwa 700 Mitarbeitende. Darunter sind 200 Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler, die an fünf Instituten und zwei Zentren intern und extern vernetzt für die Politikberatung und zum Nutzen des Gemeinwohls forschen.

Das Nationale Referenzzentrum für authentische Lebensmittel (NRZ-Authent) am Max Rubner-Institut wurde vom Bundesministerium für Landwirtschaft, Ernährung und Heimat (BMLEH) eingerichtet, um die Arbeit der amtlichen Lebensmittelüberwachung in Deutschland zu unterstützen. In diesem Zusammenhang entwickelt das NRZ-Authent umfangreiche analytische Methoden und Referenzdatenbanken, um Verfälschungen von Lebensmitteln nachzuweisen.

Zur Unterstützung des NRZ-Authent Datenmanagement-Teams am Standort Kulmbach suchen wir zum nächstmöglichen Zeitpunkt eine engagierte Wissenschaftlerin bzw. einen engagierten Wissenschaftler.

Das sind

Ihre Aufgaben:

• Entwicklung, Implementierung, und Wartung von Anwendungen und Pipelines für die automatisierte Auswertung von Daten aus biochemischen Untersuchungsmethoden
• Auswertung von Daten aus der DNA-sequenzbasierten Analytik (Metabarcoding, Metagenomics) sowie aus der Massenspektrometrie (Metabolomik, Proteomik)

Das bringen Sie mit:

• ein erfolgreich abgeschlossenes Master-Studium im Bereich Informatik, Bioinformatik, Data Science, Molekularbiologie, Biochemie, Lebensmittelchemie oder eine vergleichbare Qualifikation
• Praxis‑Erfahrung im Aufbau von Analyse‑Pipelines für NGS, Proteomik oder Metabolomik
• sicherer Umgang mit relevanten Datenbanken (z. B. NCBI, BOLD, Mascot, PRIDE, Proteome Xchange, METLIN, Mass Bank)
• fundierte Kenntnisse in gängigen Programmiersprachen (Python, Perl, R, C/C++, )
• routiniert im Arbeiten mit Linux, der Kommandozeile sowie HPC‑ bzw. Server‑Umgebungen
• mindestens gute Kenntnisse der englischen Sprache in Wort und Schrift
• sehr gute Ausdrucksfähigkeit in deutscher Sprache in Wort und Schrift

Wünschenswert sind:

• Erfahrung mit der bioinformatischen Auswertung von Sequencing‑by‑Synthesis (Illumina) oder Long‑Read‑Sequencing (Oxford Nanopore) Daten, inklusive Tools wie DADA2, QIIME2, BLAST und taxonomischer Zuordnung
• sicherer Umgang mit Container-Technologien (z. B. Docker, Podman)
• Erfahrung in der Arbeit mit Referenzdatenbanken
• nachgewiesene Mitarbeit an wissenschaftlichen Publikationen
• praktische Kenntnisse in relationalen Datenbanksystemen, vorzugsweise PostgreSQL
• Erfahrung im Umgang mit Versionsverwaltungssystemen, insbesondere Git
• sicherer Umgang mit KI-gestützten Programmierwerkzeugen (z. B. Agentic Coding)

Wir freuen uns auf eine engagierte Person, die sich durch eine hohe Motivation, Team- und Kooperationsfähigkeit sowie eine selbstständige und verantwortungsbewusste Arbeitsweise und die Fähigkeit zur inter- und intradisziplinären Zusammenarbeit auszeichnet.

• eine abwechslungsreiche Tätigkeit in einem zukunftsweisenden Forschungsinstitut am Standort Kulmbach
• eine zum nächstmöglichen Zeitpunkt
  unbefristete Stelle in Vollzeit (39,00 Stunden/Woche, entspricht 100 % einer Vollzeitstelle)
• ein Arbeitsverhältnis, das sich nach den Bestimmungen des Tarifvertrages für den öffentlichen Dienst (TVöD Bund) richtet
• eine Vergütung nach Entgeltgruppe 14 bei Erfüllung der persönlichen Voraussetzungen
• flexible Arbeitszeiten, Teilzeitmodelle und mobiles Arbeiten innerhalb der Bundesrepublik Deutschland
• 30 Urlaubstage pro Jahr (bei einer 5-Tage-Woche) sowie bis zu 12 Tage Zeitausgleich pro Kalenderjahr
• dienstfrei am 24.12. sowie 31.12.
• eine jährliche Sonderzahlung sowie eine betriebliche Altersvorsorge (VBL) und vermögenswirksame…