Promovendus LIQUID-DCI

Wil jij bijdragen aan het verbeteren van de zorg voor patiënten met een subarachnoïdale hersenbloeding door middel van onderzoek op het grensvlak van kliniek en het lab en met behulp van artificial intelligence? Dan is deze positie iets voor jou!

De LIQUID-DCI studie is een studie bij mensen met een aneurysmatische subarachnoïdale bloeding (aSAB). Een gevreesde complicatie bij dit ziektebeeld is late ischemie. Deze complicatie ontstaat binnen twee weken na de bloeding en komt bij ongeveer 25% van de aSAB-patiënten voor, maar is tot nu toe moeilijk te voorspellen. Daarom zijn alle aSAB-patiënten tot twee weken na de initiële bloeding ter observatie opgenomen in het ziekenhuis, waardoor hun revalidatieproces wordt uitgesteld en de klinische uitkomst en kwaliteit van leven mogelijk minder is.

Het doel van de LIQUID-DCI studie is om een bloedtest te ontwikkelen die verschillende aspecten in het bloed meet, waaronder genetische markers, eiwitten en de bloedstolling. In de eerste twee jaar van de studie worden bloedmonsters in vier academische ziekenhuizen in Nederland verzameld. Daarna zullen de RNA's, eiwitten en coagulatie gemeten worden. Deze data zal worden geanalyseerd middels kunstmatige intelligentie algoritmes die patronen zullen ontdekken die aangeven welke aSAB‑patiënten het laagste risico op late ischemie hebben.

Als onze aanpak succesvol is, zal de test verder worden ontwikkeld om in de kliniek toegepast te worden.

• Opzetten van een multicenter biobank van aSAB-patiënten
  • Coördineren van inclusies en bloedafnames
  • Coördineren en participeren in (klinische/radiologische) dataverzameling
  • Coördineren van transport, verwerking en opslag van bloedmonsters
  • Communicatie met lokale onderzoekers, artsen, labmedewerkers, patiënten en de METc.
• Uitvoeren en coördineren van laboratoriumanalyses: isolatie van bloedplaatjes, RNA‑extractie/-sequencing, proteomics (Olink), ROTEM‑analyses.
• Voorbewerken en beheren van grote datasets voortvloeiend uit de opgezette biobank (RNA‑seq, proteomics, ROTEM, klinische/radiologische gegevens).
• Uitvoeren van (bio) statistische analyses en (onder begeleiding) toepassen van machine learning/deep learning technieken.
• Meewerken aan proof‑of‑concept implementatie van de biomarker test (o.a. Nanopore‑platform).

• Afgeronde masteropleiding in (bio) medische wetenschappen, geneeskunde, biologie, biotechnologie, technisch geneeskunde of vergelijkbaar.
• Affiniteit met (pre‑)klinisch onderzoek, neurologie/neurovasculaire ziekten en/of laboratoriumonderzoek.
• Ervaring met of sterke interesse in moleculaire biologie, bloedafname/-verwerking, biobanking en/of laboratoriumtechnieken (zoals RNA‑extractie, proteomics, sequencing).
• Basiskennis van statistiek en/of data‑analyse met behulp van artificial intelligence; ervaring met R, Python of andere analysepakketten is een pre.
• Goede beheersing van Nederlands en Engels, zowel mondeling als schriftelijk.
• Sterke organisatorische vaardigheden; in staat om logistiek complexe multicenter studies te coördineren samen met (klinisch) PIs en lokale onderzoekers.
• Goede communicatieve vaardigheden; kan schakelen tussen laboratorium, kliniek en samenwerkende centra.
• Teamspeler, maar ook in staat om zelfstandig beslissingen te nemen.
• Nauwkeurig, kwaliteitsgericht en integer in omgang met patiëntgegevens en biomateriaal.
• Flexibel en stressbestendig; kan omgaan met onverwachte situaties in de klinische praktijk en onverwachte resultaten vanuit het onderzoek.

• Sterke organisatorische vaardigheden; in staat om logistiek complexe multicenter studies te coördineren samen met (klinisch) PI's en lokale onderzoekers.
• Goede communicatieve vaardigheden; kan schakelen tussen laboratorium, kliniek en samenwerkende centra.
• Teamspeler, maar ook in staat om zelfstandig beslissingen te nemen.
• Nauwkeurig, kwaliteitsgericht en integer in omgang met patiëntgegevens en biomateriaal.
• Flexibel en stressbestendig; kan omgaan met onverwachte situaties in de klinische praktijk en onverwachte resultaten vanuit het onderzoek.

• Je treedt in dienst bij Amsterdam UMC Research BV.
• Een contract voor de duur van 12 maanden, met de…