Post-Doctorant Biophysique computationnelle

Post-Doctorant F/H Biophysique computationnelle

Niveau de diplôme exigé : Thèse ou équivalent

Dans le cadre d’un partenariat

Le poste est à pourvoir au sein de l'équipe MOSAIC de l'Inria. L'activité scientifique de l'équipe s'articule autour de la
modélisation mathématique et de la simulation numérique dans le domaine de la biologie du développement végétal.
Le poste est à pourvoir dans le cadre du projet Morphosys Tens financé par le
programme Explorae de l'Inrae. L'objectif du projet est de combiner les formalismes de la
morphoélasticité avec la biologie des systèmes.

Sous la supervision d'Olivier Ali (chercheur à l'Inria), les deux principales tâches du jeune chercheur recherché
seront (i) de développer un formalisme mathématique pour adapter une approche systématique
aux équations différentielles à base de tenseurs et (ii) de réaliser des simulations numériques (FEM) pour
simuler la morphogenèse des tissus végétaux en croissance. Les développements théoriques et numériques
seront appliqués à l'étude de la morphogenèse des graines chez la plante modèle
Arabidopsis thaliana, en étroite collaboration avec les biologistes du laboratoire d'accueil.
Les simulations numériques seront réalisées à l'aide de la bibliothèque python dédiée basée sur la MEF
BVPy, développée par l'équipe d'accueil.
Pour plus de contexte et de détails :
Site web de l'équipe :

MOSAIC et site web du laboratoire de biologie d'accueil :

RDP.
Bibliothèque BVPy V1.0 :publication dans le Journal of Open Source Software et dépôtgitlab.

Collaboration :
Le candidat retenu sera supervisé par Olivier Ali, en étroite collaboration avec les
ingénieurs de recherche de l'équipe d'accueil et en interaction avec les biologistes du laboratoire d'accueil
.

Dérivation théorique de motifs régulateurs à partir des principes fondamentaux de la biophysique, pertinents dans le
contexte de la morphomécanique des tissus végétaux.
Mise en œuvre de simulations numériques basées sur la méthode des éléments finis (FEM), inspirées des résultats expérimentaux.
Interprétation des résultats de simulation à la lumière des développements théoriques susmentionnés.

Activités secondaires :
Activités d'enseignement et de formation (non obligatoires).

Compétences techniques :

• Expertise en géométrie différentielle
• Expertise en calcul scientifique
• Connaissance du FEM Langues : anglais français (facultatif, mais peut être utile pour les interactions quotidiennes et informelles)

Autres compétences : experience avec les outils de programmation modernes (IDE, gestion des versions...)
Présidence de réunions scientifiques

• Restauration subventionnée
• Transports publics remboursés partiellement
• Congés: 7 semaines de congés annuels + 10 jours de RTT (base temps plein) + possibilité d'autorisations d'absence exceptionnelle (ex : enfants malades, déménagement)
• Possibilité de télétravail (après 6 mois d'ancienneté) et aménagement du temps de travail
• Équipements professionnels à disposition (visioconférence, prêts de matériels informatiques, etc.)
• Prestations sociales, culturelles et sportives (Association de gestion des œuvres sociales d'Inria)
• Thème/Domaine :Biologie numérique
  Biologie et santé, Sciences de la vie et de la terre(BAP
  
  A)
• Date de prise de fonction souhaitée :
• Durée de contrat :1 an, 6 mois
• Date limite pour postuler :

Attention
:
Les candidatures doivent être déposées en ligne sur le site Inria. Le traitement des candidatures adressées par d'autres canaux n'est pas garanti.

Sécurité défense :
Ce poste est susceptible d’être affecté dans une zone à régime restrictif (ZRR), telle que définie dans le décret n° relatif à la protection du potentiel scientifique et technique de la nation (PPST). L’autorisation d’accès à une zone est délivrée par le chef d’établissement, après avis ministériel favorable, tel que défini dans l’arrêté du 03 juillet 2012, relatif à la PPST.

Un avis ministériel défavorable pour un poste affecté dans une ZRR aurait pour conséquence l’annulation du recrutement.

Politique de recrutement :
Dans le cadre de sa politique diversité, tous les postes…