Premier-ère assistant-e universitaire ou chargé-e de recherche en génétique

Contexte

• Le Centre hospitalier universitaire vaudois (CHUV) est l'un des 5 hôpitaux universitaires suisses. Grâce à sa collaboration avec la Faculté de biologie et médecine de l'Université de Lausanne et l'EPFL, le CHUV joue un rôle de pointe dans les domaines des soins médicaux, de la recherche médicale et de la formation
• Le service de médecine génétique du CHUV est composé d’une unité clinique et de laboratoires de diagnostic moléculaire et chromosomique. L’unité clinique comprend 3 médecins cadres, 3 cheffes de clinique, 3 assistants, 4 conseillers en génétique et 1 psychologue. Plus de 5000 patients sont vus en consultations par an (neurogénétique, oncogénétique, cardiogénétique, néphrogénétique, etc…)
• Les laboratoires de diagnostic moléculaire et chromosomique comprennent 4 biologistes FAMH, 6 experts scientifiques, 1 bio-informaticien et 10 techniciens de laboratoire. Plus de 2500 analyses sont réalisées par an à partir de méthodes variées (caryotype, FISH, array CGH, Sanger, MLPA, NGS, etc…). Certains patient-e-s bénéficient d’un séquençage short read après capture exome et d’une analyse Mendéliome en trio
• Vous rejoindrez une équipe de recherche nouvellement constituée. Les projets portent sur les patients suivis dans le service de Médecine Génétique et pour lesquels aucun diagnostic moléculaire n’a pu être posé malgré de multiples analyses. Nous travaillons à l’identification de nouveaux gènes responsables de maladies monogéniques rares puis sur la compréhension des mécanismes physio-pathologiques expliquant ces dysfonctionnements par des validations fonctionnelles variées (organoïdes, modèles ).
  
  Nous nous intéressons, en particulier, aux gènes responsables de troubles du neurodéveloppement d’une part et d’ataxie monogénique d’autre part

• Des collaborations avec des équipes de recherche de l’Université de Lausanne et de l’EPFL sont envisagées
• l’intégration et à l’interprétation des résultats en collaboration étroite avec les biologistes, cliniciens et bio-informaticiens du service
• la réalisation d’expériences de génétique moléculaire, incluant notamment l’extraction d’ADN/ARN, le séquençage Sanger et la qPCR
• des expériences de biologie cellulaire telles que la culture cellulaire, la transfection ou encore l’édition du génome
• la conception, à la rédaction et à la rédaction de projets de recherche en réponse à des appels d’offres
• la rédaction de publications scientifiques et à la valorisation des résultats
• une veille scientifique et technologique régulière concernant les nouvelles méthodes et approches d’analyse génomique

• d’un doctorat en génétique moléculaire ou d’un diplôme équivalent reconnu
• des compétences dans le domaine du séquençage de 2ᵉ génération (NGS), incluant la maîtrise des techniques, l’évaluation des indicateurs de qualité, l’interprétation des données de séquençage d’exomes et/ou génomes dans le domaine des maladies rares, ainsi que l’optimisation des protocoles et la résolution de problèmes expérimentaux
• les techniques de génétique moléculaire et de biologie cellulaire, et vous êtes capable de les appliquer de manière autonome et rigoureuse
• couramment le français et l’anglais
• de connaissances en langages de programmation tels que Python et R, ainsi que d’expérience dans les pipelines d’analyse NGS (BWA, GATK, SAMtools, bcftools, VEP/ANNOVAR), ce qui constitue un atout pour le poste
• de rigueur, d’autonomie et d’un excellent esprit d’équipe, et vous êtes capable de travailler sur des projets interdisciplinaires
• une grande capacité d’adaptation, de créativité et d’organisation, ainsi qu’une aptitude à gérer efficacement votre temps et vos priorités

• Devenir une collaboratrice ou un collaborateur du Centre hospitalier universitaire vaudois, c'est l'assurance de bénéficier :
• De prestations sociales de premier ordre, d'un congé paternité de 20 jours et d'un congé maternité de 4 mois (avec possibilité d’un mois supplémentaire de congé d’allaitement)
• D'une progression salariale régulière et adaptée aux responsabilités
• D’un 13ème salaire et de 25 jours de vacances par année
• D'un droit à trois jours de formation minimum par année, avec l’accès à une offre variée au sein du…