PhD-Stelle – Bioinformatik​/RNA-Biologie; d​/w​/m

Projektbeschreibung
Ziel dieses Promotionsprojekts ist es, transkriptionelle und post-transkriptionelle Regulationsmechanismen in neuroendokrinen Systemen aufzuklären, mit besonderem Fokus auf nicht-kodierende RNAs. Das Projekt verbindet die Entwicklung und Anwendung computergestützter Methoden mit der Analyse und Integration großskaliger, hochdimensionaler biologischer Datensätze aus Gehirngeweben.

Die/der Kandidat
* in arbeitet mit komplexen Datensätzen, die mehrere biologische und technische Kovariaten enthalten, und trägt zur Rekonstruktion RNA-vermittelter regulatorischer Netzwerke bei. Das Projekt umfasst integrative Multi-Omics-Analysen, fortgeschrittene statistische Modellierung sowie den gezielten Einsatz von Machine-Learning-Methoden, sofern diese biologisch sinnvoll sind. Die enge Zusammenarbeit mit experimentellen Partnern gewährleistet eine starke biologische Verankerung und hypothesengeleitete Datenanalyse.

• Abgeschlossenes oder bis zum Startdatum abgeschlossenes Masterstudium in Bioinformatik, Biologie, Informatik oder einem verwandten Fach
• Starkes Interesse und nachgewiesene Erfahrung in der Analyse von Omics-Daten
• Sehr gute Programmierkenntnisse in Python oder R sowie Bash
• Sicherer und routinierter Umgang mit Linux-basierten Rechenumgebungen
• Sehr gute Englischkenntnisse in Wort und Schrift

• Erfahrung mit großskaligen biologischen Datensätzen (z.
  
  B. Transkriptomik, Small-RNA-Daten, Proteomik oder verwandte Daten)
• Erfahrung mit multi‑parametrischen bzw. multi‑kovariaten statistischen Modellen
• Vertrautheit mit CLIP‑seq‑basierten Methoden (z.
  
  B. miR-eCLIP)
• Hintergrund oder starkes Interesse an Neurowissenschaften oder RNA‑Biologie