Poste d'ingénieur de recherche en génomique fonctionnelle des macro algues brunes; H​/F

Ingénieur De Recherche En Génétique Moléculaire Des Algues Brunes

Les histones sont des composants régulateurs importants de la chromatine eucaryote et il a été démontré que les formes variantes des protéines histones jouent des rôles cruciaux dans divers processus biologiques chez les animaux et les plantes terrestres. Faisant suite à l'identification récente de trois nouveaux variants d'histones algales de la protéine H2A, le projet ANR His2AVar vise à investiguer les rôles fonctionnels de ces nouveaux variants chez les Stramenopiles, avec un accent particulier sur les algues brunes dans le laboratoire qui accueille ce poste de technicien supérieur.

Le/la candidate utilisera la méthodologie CRISPR développée dans le laboratoire hôte pour muter les loci codant l'histone H2A dans l'organisme modèle d'algue brune Ectocarpus. Les phénotypes des mutants résultants seront ensuite analysés aux niveaux morphologique et moléculaire, ce dernier impliquant à la fois une analyse transcriptomique et une analyse de la chromatine en utilisant la méthode de ChIP-seq.

Le projet impliquera le maintien et la croissance de souches d'Ectocarpus de type sauvage et mutantes, l'application de la méthodologie CRISPR-Cas9 pour générer de nouvelles lignées mutantes et la caractérisation phénotypique de ces lignées mutantes. Le phénotypage utilisera une gamme d'approches différentes, y compris la morphométrie, les approches de biologie cellulaire, et des approches transcriptomiques et épigénétiques. Des protocoles sont disponibles dans le laboratoire d'accueil pour toutes ces approches.

Le/la candidate doit maitriser des approches standard de biologie moléculaire et de biologie cellulaire (micro scopie) et une connaissance des techniques de CRISPR et/ou le culture des algues brunes. Des compétences bio-informatiques, par exemple la capacité d'analyser des données transcriptomiques, serait également appréciée.

L'institut d'accueil :
La Station Biologique de Roscoff (S ) est un centre de recherche en biologie marine et océanologie. Il est situé dans la ville de Roscoff sur la côte nord de la Bretagne, à environ 60 km à l'est de Brest. Le personnel du S  comprend environ 200 employés permanents. Le poste est financé par l'Agence nationale de la recherche, projet His2AVar.

Il inclura des interactions fortes avec le laboratoire US2B (UMR
6286) à Nantes et l'iGReD (UMR
6293) à Clermont-Ferrand.

Pas de contrainte ni de risque spécifique

De 3143 € à 3645 € brut par mois selon expérience

44 jours

Pratique et indemnisation du TT

Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu'à 300€

Référence de l'offre - UMR
8227-JERCOC-020

Secteur d'activité
- Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement

Emploi type
- Ingenieur de recherche en experimentation et production vegetales (H/F)

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