Wissenschaftliche Mitarbeiterin​/Wissenschaftlicher Mitarbeiter Computational Structural Biolo

Wissenschaftliche Mitarbeiterin / Wissenschaftlicher Mitarbeiter
Computational Structural Biology (d/m/w) (119/25)

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Als Public-Health-Institut setzen wir uns aktiv für die Gesundheit der Bevölkerung in Deutschland ein. Daran arbeiten und forschen im Robert Koch-Institut jeden Tag gemeinsam 1.500 Menschen aus über 52 Nationen.

Unser Team ZBS 6 – Proteomik und Spektroskopie freut sich auf Ihre Bewerbung!

Das Zentrum für Biologische Gefahren und Spezielle Pathogene (ZBS) hat die Aufgabe, Ausbrüche durch hochpathogene und bioterroristische (BT) Agenzien zu erkennen, gesundheitliche Folgen zu bewerten und Konzepte zur Verhütung bzw. Bekämpfung von Infektionen oder Vergiftungen zu entwickeln. Das ZBS gliedert sich in sieben Fachgebiete (ZBS 1–7), die vielfältige Aufgaben zur Bewältigung biologischer Gefahrenlagen wahrnehmen. In den Fachgebieten des ZBS werden modernste diagnostische Verfahren mit hohem Datenaufkommen (z. B.

Genomik, Proteomik, Multiplex-Serologie, Mikroskopie) zur Erkennung, Bewertung und Bewältigung möglicher bioterroristischer Anschläge, zur Untersuchung natürlicher oder unfallbedingter Ausbrüche mit besonderen und hoch‑pathogenen Erregern und Toxinen sowie zu Forschungszwecken eingesetzt.

Um zukünftig neue Ansätze in den Bereichen Detektion und Therapie zu ermöglichen, sollen im Fachgebiet ZBS 6 „Proteomik und Spektroskopie“ neuartige KI‑basierte Verfahren zum gezielten Proteindesign entwickelt und etabliert werden.

Entwicklungsarbeiten im Rahmen eines Projekts für den Massenspektrometrie (MS)-gestützten Nachweis von hochmolekularen Agenzien im Fachgebiet ZBS 6, insbesondere

• Mitwirkung an der Entwicklung, Validierung und Etablierung von Proteomics‑basierten Detektionsverfahren im ZBS
• Etablierung von Verfahren des maschinellen Lernens (ML) für den MS‑basierten zielgenauen Nachweis bioterroristisch relevanter Proteinstrukturen
• Zusammenarbeit mit anderen Arbeitsgruppen des ZBS sowie mit entsprechenden Einrichtungen der Sicherheitsbehörden (Bund und Länder) zur KI‑basierten Modellierung von Antikörper‑Antigen-Interaktionen

• ein abgeschlossenes Hochschulstudium (Universitätsdiplom, Master) in Biologie, Chemie, Biotechnologie oder einer vergleichbaren Disziplin

Bei ausländischen Bildungsqualifikationen benötigen wir einen Nachweis über die Gleichwertigkeit mit einem deutschen Abschluss.

• in der Protein‑Strukturbiologie (z. B. NMR‑Spektrum, Röntgenkristallographie, Kryoelektronenmikroskopie, strukturelle Proteomik)
• bei der Anwendung von Programmen und Tools zur Strukturaufklärung von Proteinen (z. B. in silico Modellierung, Bioinformatik zur Strukturaufklärung)
• im technisch / naturwissenschaftlichen Bereich mit Bezug zur Protein‑Strukturbiologie und/oder Proteomik, sowie hinsichtlich der Anwendung von Methoden des maschinellen Lernens in der Strukturbiologie (Computational Structural Biology)
• sicherer Umgang mit den gängigen MS‑Office‑Programmen
• Sprachkenntnisse (CEFR‑Niveau):
  Deutsch C2, Englisch mind. C1

• Kenntnisse bei der Anwendung von Verfahren des maschinellen Lernens in der Strukturbiologie und/oder Proteomik
• Erfahrungen und Kenntnisse in der instrumentellen Analytik, idealerweise in der Flüssigchromatographie mit Massenspektrometrie‑Kopplung (LC‑MS) z. B. für die strukturelle Proteomik (Structural Proteomics)
• Programmierkenntnisse in einer modernen Programmiersprache (R, Python, Matlab, etc.)
• Kenntnisse in der in silico Modellierung von Proteinen und/oder Protein‑Antikörper-Interaktionen
• Kenntnisse im de‑novo Protein‑Design

• Lernfähigkeit und
  -bereitschaft mit dem Ziel der schnellen Einarbeitung in neue Aufgaben
• Flexibilität bei unvorhergesehen Situationen
• Aufgaben‑ und Projektplanungskompetenz mit Prioritätensetzung auf Grund von Wichtigkeit und Dringlichkeit
• Belastbarkeit und Handlungsfähigkeit auch in stressigen Arbeitssituationen
• Kritikfähigkeit und Nutzung von konstruktivem Feedback zur Verbesserung
• Serviceorientierung zur schnellen Problemlösung
• Kooperations‑ und Teamfähigkeit für ein gemeinsames…